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生物中的blast是什么

来源：互联网 时间：2023-08-02 18:46:04

今天来为大家介绍生物中的blast是什么这个问题，希望能够为大家提供一些新的视角。

什么是BLAST

BLAST，全称为基于局部相似性搜索工具（Basic Local Alignment Search Tool），是一种生物信息学中广泛使用的计算机程序。它可以在已知的DNA或蛋白质序列数据库中搜索与给定序列相似的序列。

BLAST的原理

生物中的blast是什么

BLAST利用了一种名为“快速库搜索”的算法，该算法可以将一个长度为n的查询序列与一个长为m的参考序列库进行比对。比对过程中，BLAST会将查询序列切分成多个较短的片段，并在参考库中找到与之相似的片段。然后，再使用这些片段进行比对和扩展，最终得出整个查询序列与参考库中所有可能匹配序列之间的最佳比对。

BLAST的应用

BLAST被广泛应用于生物信息学领域中，可以用来寻找已知功能或未知功能基因、识别蛋白质家族、确定物种分类、预测新药靶点等。此外，在生物医学研究中也有很多应用，例如鉴定病原体、疾病诊断和治疗等方面。

BLAST的局限性

虽然BLAST在生物信息学中应用广泛，但它也存在一些局限性。由于BLAST只能识别与已知序列相似的序列，因此对于未知功能的新基因或新蛋白质，BLAST的作用就不如其他方法那么明显了。

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